Na largada, o motor do carro de Senna falhou e ele não conseguiu fazer o carro sair do grid. Mas ao mesmo tempo que os demais pilotos de atrás se desviaram do carro do piloto brasileiro, ele manteve o pé na embreagem para deixar deslizar o carro, porque o grid de Suzuka é numa descida. Assim que ele conseguiu fazer o motor funcionar, Senna tinha caído para a 14ª posição, mas a partir daquele momento, começa a fazer uma grande corrida de recuperação.
Completou a primeira volta em 8º; a segunda em 6º; a terceira em 5º; a quarta em 4º; a 11ª volta era o 3º; quase no final da 19ª volta ia para 2º com o abandono de Capelli; ao completar a 20ª volta, Prost olha pelo retrovisor direito e vê que o 2º colocado não era o italiano da March, e sim o carro de Senna que vinha andando cada vez mais rápido.
Quando vinha para terminar a 26ª volta, o piloto francês faz o contorno da chicane e fica preso atrás do Rial de Andrea de Cesaris; com isso o brasileiro se aproxima mais na saída da chicane e no início da reta colou no carro do piloto francês; ao abrir a 27ª volta, Senna aproveitou o vácuo do seu companheiro de equipe na descida da reta dos boxes e ultrapassou-o, que ao ser ultrapassado, tentou espremê-lo na pequena área de escape da mureta dos boxes, mas isso foi em vão porque o piloto brasileiro contornou a primeira curva à frente dele.
Até ao final, não houve nenhuma novidades, e assim Ayrton Senna pôde vencer a prova e ser Campeão Mundial pela primeira vez.
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