Mais informação, retirado de um livro, refere o sistema FAT mas o raciocinio é o mesmo para NTFS.
"O sistema FAT exige que cada cluster do disco seja usado somente para um único arquivo, ou
seja, num mesmo cluster, não pode haver informações sobre mais de um arquivo. Isso pode
até parecer óbvio, mas gera um problema: desperdício. Para mostrar isso, vamos supor que
desejamos guardar numa disquete um arquivo de 5 KB. Imaginemos que este disquete tenha 8
KB de espaço e dois clusters de 4 KB. Um cluster ocuparia 4 KB do arquivo, enquanto o outro
cluster ocuparia apenas 1 KB. Como o cluster só pode trabalhar com um arquivo, haveria
desperdício de 3 KB. Vamos imaginar agora que em vez de termos clusters com 4 KB, teremos
clusters com 2 KB. Assim, 3 cluster seriam usados, sendo que um ainda apresentaria
desperdício de 1 KB. No entanto, sobrou um cluster com 2 KB, que pode ser usado por outro
arquivo.
Percebe-se com isso que o tamanho do cluster deve ser o máximo que o FAT consegue
manipular. Aliás, a principal diferença entre FAT e FAT 32, é que este último consegue
trabalhar com um número maior de clusters."
e para quem estiver à vontade no inglês, leiam
esta apresentação.
Cmpt